早在公元 628 年，包括卡塔尔半岛在内的哈萨区的基督教统治者 Mundhir bin Sawa Al Tamimi 开始信仰伊斯兰教。人们仅发现了几处来自早期伊斯兰教时期的遗址，这表明当时的卡塔尔半岛人烟稀少。倭马亚王朝时期，在公元 7 世纪至 8 世纪中期，卡塔尔成为了骆驼和马匹的繁育中心。阿巴斯王朝（公元 8-13 世纪）见证了卡塔尔海岸丰富的珍珠和珍珠业的发展。卡塔尔西北部的 Yoghbi 出土了倭马亚王朝末期的考古遗址，而公元 9-10 世纪的阿巴斯王朝初期遗址则在 Murwab 附近被发现，包括 250 座房屋、两座清真寺和一座筑有防御工事的高楼。除 Murwab 以外，大量来自阿巴斯王朝时期的其他遗址在卡塔尔北部的内陆地区被发现。

尽管主要定居中心似乎位于海湾地区的伊朗地带，但历史上鲜有对公元 10-15 世纪海湾地区的记载。在卡塔尔，两处该时期的考古遗址均位于西北海岸的 Ruwayda 和 Freyha，直至公元 18 世纪前仍有人居住。

1497 年，葡萄牙探险家瓦斯科·达·伽马穿过好望角，抵达印度，建立了欧洲至东方的海上之路。欧洲人从此首次能够在海湾地区建立永久性的贸易基地。在 16 世纪和 17 世纪初，奥斯曼帝国、萨非王朝和葡萄牙开始争夺如今的卡塔尔领地。托勒密绘制的地图是最早包含卡塔尔的地图（陈列于卡塔尔国家图书馆），将“卡塔拉”标记为一处要塞。在 16 世纪 80 年代至 90 年代，葡萄牙旅行者们曾提及卡塔尔，而在 1596 年的路易斯·拉萨罗世界地图中，卡塔尔是一处孤独的要塞。卡塔尔频繁出现在地图上是在 1602 年后，当时葡萄牙败给了萨非王朝，失守巴林。在此之后，葡萄牙人以卡塔尔为基地袭击巴林，并向穿越海湾地区的商人征税。人们在 Ruwayda 挖掘出了一处葡萄牙堡垒，这可能与葡萄牙资料中提及的堡垒同属一处。

奥斯曼帝国与卡塔尔之间的联系最早可追溯至 1555 年，卡塔尔属于哈萨的奥斯曼省，于 16 世纪 50 年代被占领。在 16 世纪，葡萄牙与奥斯曼帝国势不两立，在巴林问题上尤为如此，而葡萄牙于 1521 至 1602 年间占领了巴林。然而在 17 世纪 70 年代，巴努·哈利德部落的酋长将土耳其人从哈萨驱逐出境，疑似将所有土耳其人全部从卡塔尔消灭。

在这个关键时期，卡塔尔见证了曾经统治卡塔尔和科威特广袤土地的巴尼·哈立德等众多部族的崛起。至少从 16 世纪开始，Al-Musslam 部落便是统治卡塔尔半岛的主要部族。18 世纪前居住在该地区的其他部落包括 Al-Naim，或来自海湾地区伊朗地带的航海阿拉伯部落联盟 Al-Hawala。在 18 世纪，科威特、卡塔尔与巴林由 Utub 部落联盟的成员统治，该联盟由多个部族组成，其中包括 Al-Sabah、Al-Khalifa、Al-Fadhil 和 Al-Jalahimah。尽管 Utub 的多数部落来自阿拉伯中部，但在某一时刻，他们开始以航海业为主，而船成为了主要的交通方式。

尽管考古和历史证据相对不足，但据了解，一些 17 世纪的遗址曾被占领。截至 18 世纪末，定居点星罗棋布，尤其在卡塔尔半岛的北部海岸。18 世纪较为重大的变化是葡萄牙人口大量消失，以及荷兰、法国与英国商人的到来。尽管在 17 世纪，这些国家都曾占领过海湾地区，但在 18 世纪竞争愈加激烈，这导致 19 世纪初这里被英国独占，并为卡塔尔的现代历史奠定了基础。